בכפר מכבי מערכת חינוך לגיל הרך המספקת מסגרת איכותית לחינוך הילדים החל מתום חופשת לידה ועד בית הספר.מערכת הגיל הרך מנוהלת בתפיסה חינוכית קיבוצית-קהילתית על ידי אנשי מקצוע והנהלת חינוך בליווי ייעוץ מקצועי. במערכת פועלים שישה בתי ילדים: בית תינוקות רימון, פעוטון הדס, גנון ערבה, גנון תמר וגן בוגר שקד. המערכת מתאפיינת בלמידה חווייתית חושית בגן, בחצר ובטיולים ברחבי הקיבוץ. בנוסף נהנים הילדים מסל תרבות עשיר הכולל חוגי תנועה וריתמוסיקה.
המערכת פעילה בימים א'-ה' בין השעות 07:00-16:30 ובימי שישי וערבי חג בין השעות 07:00-13:00.
בית הספר היסודי ״ניצני זבולון״ נמצא בתחום המועצה ליד הקיבוץ. בבית הספר מתחנכים רוב ילדי המועצה.
חטיבת ביניים ותיכון ״כרמל זבולון״ – קיבוץ יגור
חטיבת הביניים והתיכון ״כרמל זבולון״ נמצאים בקיבוץ יגור. בחטיבת הביניים והתיכון מתחנכים בני נוער מכל ישובי המועצה. בית הספר שם דגש רב על חינוך חברתי-קהילתי. הלימודים מתקיימים בימים א׳-ה׳. אל/מבית הספר מגיעה הסעה מסודרת ע״י המועצה האזורית.
בית ילדים ״אלון״ מרכז פעילות לילדי ביה״ס בכיתות א׳-ו׳, מסיום יום הלימודים עד השעה 16:30 בימים א׳-ה׳ וכמו כן מתקיימת פעילות ענפה בחופשות החגים ובחופש הגדול.
מועדון מרכזון-נעורים לילדי כיתות ז׳-י״ב, מרכז מפגשים חברתיים והדרכה כ- 3פעמים בשבוע וכמו כן ,פעילות מגוונת בחופשות החגים ובחופש הגדול.
